“The organization and evolution of the protein genotype-phenotype map” Evandro Ferrada’s Lecture

Friday, 10 May, 2013 | CALENDAR, EVENTS, NEWS

Tuesday, 14 de May, 2013
11:30to12:50

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Evandro Ferrada holds a Ph.D. in evolutionary biology from the University of Zurich and a professional title in biochemistry from the Universidad Católica de Chile. He attended SFI’s Complex Systems Summer School in Argentina in 2008. He currently is an Omidyar Fellow from the Santa Fe Institute.

Lecture:  “The organization and evolution of the protein genotype-phenotype map”

When: Tuesday, 14th May, 11:30 hrs.

Where: Sala Penal, Universidad del Desarrollo, campus Rector Ernesto Silva Bafalluy, Av. La Plaza 680, Las Condes.

Language: Spanish (questions and commentaries in English are very welcome).

Abstract: The hierarchical process of biological development can be encapsulated by the idea of a mapping between genetic information (i.e. genotype) and form (i.e. phenotype). The simplest examples of genotype-phenotype maps are macromolecular systems such as the relation between sequence and structure in RNA and proteins, or the collection of enzymes and metabolites of a metabolic network. The organization of the map between genotypes and phenotypes provides important information on the dynamics and constraints operating on the evolutionary process of these systems. For instance, the number of similar sequences that fold onto a given structure provides information on both, the structure’s robustness to mutations and its ability to evolve other phenotypes. In this talk I will elaborate on our current knowledge of the genotype-phenotype map of proteins. I will describe the main properties of this map and the seemingly unrelated ideas from different fields that have shed light on its organization and evolution.

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This lecture is part of the activities of the proyject “Anillo en Complejidad Social” SOC-1101, PIA- CONICYT.

ESPAÑOL

Evandro Ferrada tiene un doctorado en  biología evolutiva de la Universidad de Zurich y un título profesional en bioquímica de la Universidad Católica de Chile. Asistió a la Escuela de Verano de Sistemas Complejos de SFI en Argentina en 2008. En la actualidad es Omidyar Fellow del Instituto de Santa Fe.

Charla: “Organización y evolución del mapa genotipo-fenotipo de la proteína”

Cuándo: martes 14 de mayo, 11:30 hrs.

Dónde:  Sala Penal, Universidad del Desarrollo, campus Rector Ernesto Silva Bafalluy, Av. La Plaza 680, Las Condes.

Idioma: Español (preguntas y comentarios en inglés son bienvenidos)

Resumen: El proceso jerárquico de desarrollo biológico puede ser encapsulado por la idea de un mapeo entre la información genética (es decir, el genotipo) y la forma (es decir fenotipo). Los ejemplos más simples de mapas genotipo-fenotipo son sistemas macromoleculares tales como la relación entre la secuencia y estructura de ARN y proteínas, o la colección de enzimas y metabolitos de una red metabólica. La organización del mapa entre los genotipos y fenotipos ofrece información importante sobre la dinámica y las restricciones operativas en el proceso evolutivo de estos sistemas. Por ejemplo, el número de secuencias similares que se pliegan en una estructura dada proporcionan información sobre ambas, la robustez de la estructura a mutaciones y su capacidad de evolucionar otros fenotipos. En esta charla me extenderé en nuestro conocimiento actual del mapa genotipo-fenotipo de las proteínas. Describiré las principales características de este mapa y las ideas aparentemente inconexas de diferentes ámbitos que han arrojado luz sobre su organización y evolución.

Póster:
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Esta charla es parte de las actividades del proyecto “Anillo en Complejidad Social” SOC-1101, PIA- CONICYT.